FileZilla es un buen cliente FTP open source (existe también un servidor FTP FileZilla) que suele asociarse en exclusiva al entorno Windows.
Pero también hay versiones para otros sistemas operativos (PowerPC, FreeBSD, Linux…) Puedes encontrarlas y descargarlas en las Nightly Builds del sitio de FileZilla, que se actualizan casi diariamente.
La versión para Linux está comprimida en tar.bz2. Una vez bajada y descomprimida, sólo queda arrancar el programa desde el ejecutable filezilla que está en la carpeta bin.